Met de Škoda Octavia WRC, die voorgesteld werd in 1999, trad de fabriek voor het eerst toe tot de top van het World Rally Championship (WRC). De Octavia WRC behaalde zijn grootste overwinning in de zwaarste langeafstandsrally ter wereld, de Safari Rally in Kenia: de Duitse fabrieksrijder Armin Schwarz behaalde in 2001 een uitstekende derde plaats samen met zijn corijder Manfred Hiemer.